JEAN GUILLOU expresa su creatividad en múltiples facetas de su arte.

Como intérprete, ha ampliado considerablemente los límites técnicos de la interpretación del órgano. También pianista, trajo de nuevo a la vida la Sonata para piano de Julius Reubke, alumno de Liszt que murió a la temprana edad de 24 años, dejando dos obras maestras: la piano sonata, y una sonata de órgano. Jean Guillou es el único músico que ha interpretado y grabado ambas obras juntas. En el 2002 inauguró el pedal Borgato...piano en el Teatro Olímpico de Vicenza y en la Opéra Royal de Versailles.

Como compositor, desde muy joven ha desarrollado un mundo musical singular de una elocuencia dramática fuertemente individualista. Descubrió una nueva naturaleza de la paleta del órgano, y ha buscado mostrarla en confrontación con el piano (Coloquios 2, 4, 5, 7) o con otros instrumentos como el violín, el cello, la flauta, el clarinete, la percusión, la marimba y la voz humana, así como en los siete conciertos para órgano y orquesta. Su universo se expresa también en tres sinfonías, dos piano conciertos, música vocal, música de cámara (especialmente el trío para tres chelos, el cuarteto para oboe y cuerdas, y el trío para percusión), y obras para el piano. Su música es publicada por Schott Musik.

Como improvisador, Jean Guillou ha dado un nuevo impulso a una improvisación auténticamente creativa, liberada de los esquemas del pasado.

Inventor de una nueva forma de pensar en el órgano, aplicó sus ideas innovadoras a varios órganos, en el Alpe d'Huez, en el Conservatorio de Nápoles, en la Tonhalle de Zürich, en la sala de conciertos de Tenerife, en el "Chant d'Oiseaux" de Bruselas, y en la Iglesia portuguesa de Roma.

El desarrollo final de sus ideas conduce al "Órgano de Estructura Variable", descrito en su libro "L'Orgue, Souvenir et Avenir" (El órgano, recuerdo y futuro), en su tercera edición en Francia, con una segunda edición en Alemania y una primera en Italia. El libro cuenta la historia del instrumento y desarrolla sus ideas sobre la compleja naturaleza del órgano, al que quiere insuflar una mayor riqueza poética.

Como escritor, Jean Guillou ha publicado numerosos textos sobre música, así como poemas y textos literarios. Muchas de sus composiciones utilizan sus propios textos: "Alice au Pays de l'Orgue" para órgano y narrador, "Aube" para 12 voces y órgano, "Poème de la Main" para soprano y órgano, y "Écho" para coro y conjunto instrumental.

Jean Guillou enseñó de 1970 a 2005 en el Meisterkursus de Zürich, junto con Geza Anda, Nathan Milstein, Gregor Piatigorsky y Vladimir Spivakov, guiando a más de 300 jóvenes músicos de todo el mundo.

Universal lanzará en el 2009 las grabaciones completas que realizó durante los años 1960/70 (13 CDs) pero también ha publicado, bajo el sello de Philips, 7 CDs de sus composiciones para órgano, otros instrumentos y voz, así como las obras completas de J.S. Bach, un CD sobre el doble pianode Borgato, un CD de Mozart y 3 CDs grabados en el Conservatorio de Nápoles. Otros sellos (Dorian, Festivo, Pierre Vérany, Carrara, Augure) completan su discografía.

Su obra es objeto de varios trabajos académicos, de Jean-Philippe Hodant ("Retórica y dramaturgia en las obras de Jean Guillou", en francés), Thomas Dahl (sobre sus conciertos), Giampaolo di Rosa (sobre el arte del registro y su papel estructural), así como de trabajos analíticos de Sylviane Falcinelli.