Es Director Musical de la Wiener Staatsoper desde septiembre de 2020. Bajo su dirección, la "Haus am Ring" ha presentado nuevas producciones de Madama Butterfly, Parsifal, Macbeth, Le nozze di Figaro, Die Meistersinger von Nürnberg, Tristan und Isolde, Salome, Il Trittico, y un nuevo ciclo completo Da Ponte de Mozart. En la temporada 2024/25, dirigirá nuevas producciones de Don Carlo y Tannhäuser, así como reposiciones del ciclo Da Ponte y Der Ring des Nibelungen. 

También en 2024/25, Jordan dirigirá Parsifal en la Staatsoper Unter den Linden de Berlín y regresará al Salzburger Festspiele para revivir Macbeth. Sus apariciones sinfónicas esta temporada incluyen un regreso a la Wiener Symphoniker para la Octava Sinfonía de Mahler, seguido de regresos a la Orchestre National de France, la Boston Symphony, la Los Angeles Philharmonic, la Münchner Philharmoniker y la Israel Philharmonic, así como debuts con la WDR Sinfonieorchester y la Orchestre Philharmonique de Monte Carlo. 

La carrera de Jordan en el podio comenzó como Kapellmeister en el Theater Ulm de Alemania y en la Staatsoper Unter den Linden de Berlín. De 2001 a 2004 fue director director de orquesta de la Ópera de Graz y de la Orquesta Filarmónica de Graz, periodo durante el cual también debutó en varios de los principales teatros y festivales de ópera del mundo, como la Metropolitan Opera de Nueva York, la Royal Opera House Covent Garden, el Teatro alla Scala, la Bayerische Staatsoper, la Wiener Staatsoper, el Festspielhaus Baden-Baden y los festivales de Aix-en-Provence, Glyndebourne y Salzburgo. De 2006 a 2010 regresó a la Staatsoper de Berlín como principal invitado director de orquesta. En el verano de 2012 debutó en el Festival de Bayreuth con Parsifal, regresando de nuevo en 2017 con la nueva producción de Bayreuth de Die Meistersinger von Nürnberg, que también dirigió en años posteriores.  

Jordan fue director musical de la Ópera Nacional de París entre 2009 y 2021, dirigiendo numerosos estrenos y reposiciones, como Moses und Aron, La damnation de Faust, Der Rosenkavalier, Samson et Dalila, Lohengrin, Don Carlos (en su versión original francesa), Les Troyens, Don Giovanni, una nueva producción del Príncipe Igor de Borodin y el ciclo del Anillo de Wagner en versión de concierto.  

De 2014 a 2020, Philippe Jordan fue director director de orquesta de la Wiener Symphoniker. Entre los hitos de su mandato con la orquesta se incluyen los ciclos completos de las sinfonías de Schubert y Beethoven y los conciertos de piano , un ciclo de las principales misas y oratorios de J.S. Bach y un diálogo lleno de contrastes de las tres últimas sinfonías de Bruckner con clásicos modernos de Kurtág, Ligeti y Scelsi. 

Como sinfónico director de orquesta, Philippe Jordan ha trabajado con las orquestas más famosas del mundo, entre ellas la Berliner Philharmoniker, la Wiener Philharmoniker, la Concertgebouworkest, la Münchner Philharmoniker, la Wiener Symphoniker, la London Symphony Orchestra, la Orchestra Filarmonica della Scala, la Orchestra dell'Accademia Nazionale di Santa Cecilia de Roma, la Orchestra Sinfonica Nazionale RAI, Tonhalle-Orchester Zürich, Chamber Orchestra of Europe, Mahler Chamber Orchestra, Gustav Mahler Jugendorchester, Israel Philharmonic Orchestra, Orchestre de Paris, Orchestre National de France, y las orquestas sinfónicas de Boston, Seattle, St. Louis, Dallas, Detroit, Chicago, Cleveland, Filadelfia, Washington, Minnesota, Montreal, Los Ángeles, Nueva York y San Francisco.