Es director musical de la Wiener Staatsoper desde septiembre de 2020 e inauguró su primera temporada con nuevas producciones de Madama Butterfly, Parsifal, y Macbeth junto con reposiciones de El caballero de la rosa y Le nozze di Figaro. En la temporada 2021/22 se estrenaron nuevas producciones de Don Giovanni, Wozzecky Tristán e Isolda. En la temporada actual, dirige nuevas producciones de Die Meistersinger von Nürnberg, Salomé, y Le nozze di Figaro y reposiciones de Don Giovanni, Der Rosenkavalier, Tristan und Isolde, Wozzeck, y Parsifal.

Las apariciones como invitado en la temporada 2022/23 le llevan a la Orquesta Nacional de Francia, la Filarmónica de Múnich, la Filarmónica de Los Ángeles, la Sinfónica de San Francisco y el Teatro del Maggio Musicale Fiorentino. Se le podrá ver con la Filarmónica de Viena en conciertos sinfónicos en el Konzerthaus Wien en la primavera de 2023. 

La carrera de Jordan en el podio comenzó como Kapellmeister en el Stadttheater Ulm de Alemania y en la Staatsoper Unter den Linden de Berlín. De 2001 a 2004, fue director director de orquesta de la Ópera de Graz y de la Orquesta Filarmónica de Graz, periodo durante el cual también debutó en varios de los principales teatros y festivales de ópera del mundo, como la Metropolitan Opera; la Royal Opera House, Covent Garden; el Teatro alla Scala; la Ópera Estatal de Baviera; la Wiener Staatsoper; el Festspielhaus Baden-Baden; y los festivales de Aix-en-Provence, Glyndebourne y Salzburgo. De 2006 a 2010, regresó a la Ópera Estatal de Berlín como principal invitado director de orquesta. En el verano de 2012, debutó en el Festival de Bayreuth con Parsifal, regresando de nuevo en 2017 con la nueva producción de Bayreuth de Die Meistersinger von Nürnbergque también dirigió en años posteriores.

Jordan fue director musical de la Ópera Nacional de París entre 2009 y 2021, periodo durante el cual dirigió numerosos estrenos y reposiciones, entre ellos Moses und Aron, La damnation de Faust, Der Rosenkavalier, Samson et Dalila, Lohengrin, Don Carlos (en su versión original francesa), Les Troyens, Don Giovanniuna nueva producción de Borodin El Príncipe Igor y el Anillo de Wagner en versión de concierto.

De 2014 a 2020, Jordan fue director director de orquesta de la Wiener Symphoniker. Entre los hitos de su mandato con la orquesta se incluyen ciclos completos de las sinfonías de Schubert y Beethoven y conciertos piano , un ciclo de misas y oratorios de J.S. Bach y un diálogo lleno de contrastes de las tres últimas sinfonías de Bruckner con clásicos modernos de Kurtág, Ligeti y Scelsi. 

Como sinfónico director de orquesta, Philippe Jordan ha trabajado con las orquestas más famosas del mundo, entre ellas la Berliner y Wiener Philharmoniker, Münchner Philharmoniker, Wiener Symphoniker, London Symphony Orchestra, Orchestra dell'Accademia Nazionale di Santa Cecilia de Roma, Tonhalle Orchester Zürich, Orquesta de Cámara de Europa, Orquesta de Cámara Mahler, Gustav Mahler Jugendorchester, Filarmónica de Israel, Filarmónica de Los Ángeles, Filarmónica de Nueva York y las orquestas sinfónicas de Boston, Seattle, Saint Louis, Dallas, Detroit, Chicago, Cleveland, Filadelfia, Washington, Minnesota, Montreal y San Francisco.